21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0420 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 552 aa  1129    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  40.58 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  39.79 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  40 
 
 		 502 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  39.88 
 
 		 504 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  38.54 
 
 		 502 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  38.12 
 
 		 502 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  40.86 
 
 		 496 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  38.7 
 
 		 605 aa  342  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  39.01 
 
 		 595 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  38.81 
 
 		 600 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  40.17 
 
 		 609 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  34.94 
 
 		 537 aa  322  8e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  33.74 
 
 		 526 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  36.25 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  32.48 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  31.52 
 
 		 502 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  30.11 
 
 		 746 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  28.78 
 
 		 485 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  26.2 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>