27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2053 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  68.97 
 
 		 600 aa  791    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  69.14 
 
 		 595 aa  790    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1222    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  50.77 
 
 		 537 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  38.93 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  37.76 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  36.45 
 
 		 516 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  37.14 
 
 		 502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  37.8 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  37.22 
 
 		 502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  38.76 
 
 		 552 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  34.8 
 
 		 515 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  35.23 
 
 		 502 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  37.24 
 
 		 609 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  35.73 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  34.06 
 
 		 526 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  36.27 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  30.52 
 
 		 746 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.47 
 
 		 509 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.16 
 
 		 483 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00132321  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.75 
 
 		 509 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.16 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0834  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.37 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.933668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.33 
 
 		 459 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 731 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3841  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.66 
 
 		 490 aa  43.9  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626052  normal  0.467321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>