29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0161 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  63.98 
 
 		 502 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  64.31 
 
 		 502 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  63.91 
 
 		 502 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  77.17 
 
 		 516 aa  788    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  64.59 
 
 		 502 aa  654    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 504 aa  1016    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  39.78 
 
 		 552 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  39.39 
 
 		 595 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  38.93 
 
 		 605 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  39.39 
 
 		 600 aa  348  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  39.01 
 
 		 515 aa  346  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  39.21 
 
 		 537 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  37.3 
 
 		 526 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  40.7 
 
 		 609 aa  332  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  35.94 
 
 		 506 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  37.1 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  36.13 
 
 		 496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  31.13 
 
 		 746 aa  250  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 467 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 635 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.34 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.84 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  33.63 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  32.74 
 
 		 454 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 731 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>