98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1289 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  86.76 
 
 		 219 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  40.85 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  39.53 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  41.4 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  39.34 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  38.39 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  42.25 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  37.96 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  38.03 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  39.34 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  39.34 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  37.09 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  36.36 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  38.86 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  37.04 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1721  hypothetical protein  38.86 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.434202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1748  hypothetical protein  38.39 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  35.85 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  38.5 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  40.47 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  35.07 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  34.6 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  34.26 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2236  hypothetical protein  37.91 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  37.21 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  33.8 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2226  hypothetical protein  37.91 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2188  hypothetical protein  37.91 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1833  hypothetical protein  37.91 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1105  hypothetical protein  37.91 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1343  hypothetical protein  37.91 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0064  hypothetical protein  37.91 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152199  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2352  hypothetical protein  37.91 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  36.74 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  33.65 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0078  hypothetical protein  35.48 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  26.32 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  29.68 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  32.08 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  33.5 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  30.16 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0623  hypothetical protein  26.91 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  29.47 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  31.65 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  26.13 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1483  hypothetical protein  24.87 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1500  hypothetical protein  24.87 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  29.86 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  29.11 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  29.11 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  28.37 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  30.05 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  27.23 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  29.29 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1253  hypothetical protein  28.17 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0736  Protein of unknown function DUF2133  26.6 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1231  hypothetical protein  27.7 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.50752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1546  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0487  hypothetical protein  26.97 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  27.44 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  29.29 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1230  hypothetical protein  27.23 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0374  hypothetical protein  26.71 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1301  hypothetical protein  27.23 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.311769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3003  hypothetical protein  27.44 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  28.72 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  27.44 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1434  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000778847  normal  0.941681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0654  hypothetical protein  27.7 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.755605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  28.04 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  25.39 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  26.29 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2650  hypothetical protein  25.94 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1900  hypothetical protein  32.18 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000294416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0389  hypothetical protein  26.71 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0684  hypothetical protein  27.1 
 
 		 264 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  26.37 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  26.37 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  27.32 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  26.32 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1307  tetratricopeptide TPR_4  28.12 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000516271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01056  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06110  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0820  hypothetical protein  25.6 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.187346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1118  hypothetical protein  24.32 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.587767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2543  hypothetical protein  27.12 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1258  tetratricopeptide TPR_2  24.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  37.5 
 
 		 1059 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0406  hypothetical protein  22.16 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  31.13 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  31.13 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1660  hypothetical protein  26.34 
 
 		 212 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  30.19 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3303  hypothetical protein  22.14 
 
 		 223 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>