130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0078 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0078  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  62.9 
 
 
225 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  61.54 
 
 
225 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  55.4 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  63.33 
 
 
221 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  55.4 
 
 
230 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  55.7 
 
 
227 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  52.53 
 
 
230 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  54.46 
 
 
231 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  52.49 
 
 
224 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  46.12 
 
 
228 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  43.27 
 
 
211 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  43.27 
 
 
211 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  43.27 
 
 
211 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  40.76 
 
 
209 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  40.76 
 
 
209 aa  141  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  43.75 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  39.53 
 
 
212 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  39.9 
 
 
210 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  39.81 
 
 
209 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  40.76 
 
 
209 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  40.76 
 
 
209 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1343  hypothetical protein  44.08 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2352  hypothetical protein  44.08 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1833  hypothetical protein  44.08 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0064  hypothetical protein  44.08 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2188  hypothetical protein  44.08 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2226  hypothetical protein  44.08 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1105  hypothetical protein  44.08 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58844  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  40.76 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  38.39 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  39.81 
 
 
208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1748  hypothetical protein  39.81 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1721  hypothetical protein  39.81 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.434202 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  36.87 
 
 
219 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2236  hypothetical protein  41.23 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  34.15 
 
 
212 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  35.48 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  37.98 
 
 
213 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  101  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  34.12 
 
 
214 aa  98.6  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  33.01 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  33.01 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  31.77 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  32.62 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  32.62 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  31.22 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  28.95 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  29.76 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  29.76 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  29.76 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1500  hypothetical protein  27.01 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1483  hypothetical protein  27.01 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4323  hypothetical protein  29.27 
 
 
213 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000219277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  32.04 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  27.06 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0623  hypothetical protein  29.49 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  30.14 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  27.27 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1660  hypothetical protein  32.08 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  30.77 
 
 
208 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  32.07 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  27.67 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1546  tetratricopeptide TPR_4  29.41 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1230  hypothetical protein  28.16 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833098  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1301  hypothetical protein  28.16 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.311769  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  29.27 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1231  hypothetical protein  28.16 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.50752  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0374  hypothetical protein  28.95 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  28.5 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3007  hypothetical protein  32.56 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  28.16 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  27.78 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  27.78 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  27.45 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1434  tetratricopeptide TPR_4  28.43 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000778847  normal  0.941681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  27.67 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  27.67 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  28.42 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  28.42 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3003  hypothetical protein  27.67 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0731  putative outer membrane protein  30.85 
 
 
203 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1258  tetratricopeptide TPR_2  27.94 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2650  hypothetical protein  27.18 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0389  hypothetical protein  28.29 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  26.98 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0290  hypothetical protein  31.98 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1900  hypothetical protein  27.27 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000294416  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2735  hypothetical protein  27.98 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0654  hypothetical protein  31.91 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.755605  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3124  TPR-like domain-containing protein  29.65 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3607  hypothetical protein  24.17 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.55841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1120  hypothetical protein  28.74 
 
 
206 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0684  hypothetical protein  31.91 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020794  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1188  hypothetical protein  25.95 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.358508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0416  hypothetical protein  25.95 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1295  hypothetical protein  25.95 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1253  hypothetical protein  30.63 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2778  hypothetical protein  30.54 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2715  hypothetical protein  30.54 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>