123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2375 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  41.51 
 
 
212 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  40.95 
 
 
211 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  40.48 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  36.49 
 
 
213 aa  154  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  40.95 
 
 
211 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  39.52 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  39.52 
 
 
210 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  38.19 
 
 
228 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  40.89 
 
 
209 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  38.31 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  39.9 
 
 
209 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  39.41 
 
 
209 aa  144  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  35.15 
 
 
230 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  40 
 
 
227 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  39.9 
 
 
208 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1748  hypothetical protein  38.92 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1721  hypothetical protein  38.42 
 
 
209 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.434202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  35.15 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2236  hypothetical protein  41.87 
 
 
209 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1343  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2352  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1833  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0064  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2188  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2226  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1105  hypothetical protein  40.39 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  38.68 
 
 
214 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  37.56 
 
 
224 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  38.92 
 
 
221 aa  118  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  37.26 
 
 
231 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  34.13 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  32.2 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  32.39 
 
 
209 aa  98.6  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0078  hypothetical protein  34.15 
 
 
226 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  31.71 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  32.71 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  34.29 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  29.76 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  29.27 
 
 
214 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  31.34 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4323  hypothetical protein  28.02 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000219277 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  25.94 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  29.27 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  26.32 
 
 
219 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  29.27 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  31.92 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  28.73 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  29.27 
 
 
213 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0820  hypothetical protein  32.18 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.187346  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  28.73 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  27.54 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  27.54 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  27.54 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1500  hypothetical protein  23.08 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1483  hypothetical protein  23.08 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  31.32 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1546  tetratricopeptide TPR_4  30.66 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  30.58 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  30.48 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  26.8 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1434  tetratricopeptide TPR_4  32.41 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000778847  normal  0.941681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  30.37 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3003  hypothetical protein  28.77 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0623  hypothetical protein  25.35 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  28.64 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  28.3 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1120  hypothetical protein  25.62 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0406  hypothetical protein  25.96 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  27.7 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2650  hypothetical protein  27.7 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  28.17 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1230  hypothetical protein  27.1 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833098  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1301  hypothetical protein  27.1 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.311769  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1231  hypothetical protein  27.1 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.50752  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2735  hypothetical protein  26.21 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004347  hypothetical protein  28.64 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1258  tetratricopeptide TPR_2  27.91 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3737  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3007  hypothetical protein  24.76 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0736  Protein of unknown function DUF2133  25 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1660  hypothetical protein  28.29 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.324034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02405  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.23251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1155  conserved hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0910904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02367  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.350495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0731  putative outer membrane protein  30.19 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2664  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00194573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2797  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00154022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1307  tetratricopeptide TPR_4  28.17 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000516271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1164  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.122188  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2665  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.296084 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2888  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0840706  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2715  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2778  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>