64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2543 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2543  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2277  hypothetical protein  45.12 
 
 
217 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0282923  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3507  hypothetical protein  44.29 
 
 
218 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3774  hypothetical protein  49.52 
 
 
217 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126106  normal  0.979023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3007  hypothetical protein  41.2 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11486  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2022  hypothetical protein  45.71 
 
 
217 aa  158  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2446  hypothetical protein  44.29 
 
 
217 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.223439  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1684  hypothetical protein  43.81 
 
 
217 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0452445  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0487  hypothetical protein  37.74 
 
 
227 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3889  hypothetical protein  44.19 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0529534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0691  hypothetical protein  36.53 
 
 
223 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4513  hypothetical protein  35.61 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.105254 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0389  hypothetical protein  39.63 
 
 
223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3303  hypothetical protein  37.07 
 
 
223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0374  hypothetical protein  39.17 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4042  hypothetical protein  43.1 
 
 
236 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.163907  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4412  hypothetical protein  43.1 
 
 
236 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2605  hypothetical protein  40.65 
 
 
236 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.324907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4524  hypothetical protein  41.81 
 
 
237 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0763  hypothetical protein  38.36 
 
 
328 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0290872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2847  hypothetical protein  35.78 
 
 
227 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121763  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3116  hypothetical protein  33.94 
 
 
227 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2496  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2318  hypothetical protein  38.16 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.273967  normal  0.21146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1201  hypothetical protein  32.89 
 
 
261 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214764  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0373  hypothetical protein  30.92 
 
 
223 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4624  hypothetical protein  38.97 
 
 
236 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3494  hypothetical protein  38.17 
 
 
240 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.645241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3104  hypothetical protein  30.23 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1354  hypothetical protein  31.86 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  0.0207762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2697  hypothetical protein  31.86 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0809503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1164  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0432197  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2162  hypothetical protein  32.67 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3086  hypothetical protein  34.33 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0752  hypothetical protein  31.7 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  30.6 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3124  hypothetical protein  25.37 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2198  hypothetical protein  31.25 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.622668  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0943  hypothetical protein  26.2 
 
 
253 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  30.46 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  25.32 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3589  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0989  hypothetical protein  33.87 
 
 
222 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  31.58 
 
 
210 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  28.5 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2425  hypothetical protein  31.33 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.77812  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2205  hypothetical protein  27.78 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.282453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  31.54 
 
 
209 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  30.37 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  31.54 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  27.12 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  29.63 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0623  hypothetical protein  21.82 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  29.84 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  30.36 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  35.71 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0078  hypothetical protein  36.59 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  31.03 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  32.76 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  32.76 
 
 
209 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  32.76 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  29.31 
 
 
225 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>