125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1172 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  98.22 
 
 		 225 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  60 
 
 		 230 aa  261  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  54.42 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  63.68 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  57.73 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  59.28 
 
 		 227 aa  238  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  51.13 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0078  hypothetical protein  61.54 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  50.45 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  49.28 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  43.48 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  42.51 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  42.03 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  43.75 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  42.03 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2236  hypothetical protein  45.32 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  41.87 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1343  hypothetical protein  44.33 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2352  hypothetical protein  44.33 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  41.38 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1833  hypothetical protein  44.33 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0064  hypothetical protein  44.33 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2188  hypothetical protein  44.33 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2226  hypothetical protein  44.33 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1105  hypothetical protein  44.33 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  38.92 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  39.41 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  40.89 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  40.89 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  40.89 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  38.68 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1748  hypothetical protein  40.39 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1721  hypothetical protein  40.39 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.434202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  38.42 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  37.09 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  39.53 
 
 		 219 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  34.13 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  36.49 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  32.71 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  34.93 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  35.57 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  35.57 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  34.02 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  36.63 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  33.68 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  33.68 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  32.47 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  32.47 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  32.24 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4323  hypothetical protein  31.96 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000219277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  32.09 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  31.96 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1500  hypothetical protein  26.51 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1483  hypothetical protein  26.51 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  34.33 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  32.63 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  33.15 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  30.27 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  29.47 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  30.95 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1900  hypothetical protein  30.67 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000294416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0654  hypothetical protein  26.85 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.755605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0684  hypothetical protein  26.73 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  28.96 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  27.51 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0623  hypothetical protein  30.2 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  27.51 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  29.51 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3007  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  29.51 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1230  hypothetical protein  28.42 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1301  hypothetical protein  28.42 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.311769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0736  Protein of unknown function DUF2133  28.65 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  27.01 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1231  hypothetical protein  28.42 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.50752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3003  hypothetical protein  28.96 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1258  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524516  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  27.22 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1660  hypothetical protein  29.03 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004347  hypothetical protein  30.21 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2650  hypothetical protein  26.67 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2735  hypothetical protein  27.01 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0290  hypothetical protein  30.73 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3124  TPR-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1188  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.358508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0416  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1295  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1546  tetratricopeptide TPR_4  30.56 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3737  hypothetical protein  27.96 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1120  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0731  putative outer membrane protein  28.57 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01056  hypothetical protein  29.95 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06110  hypothetical protein  29.95 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  29.22 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02405  hypothetical protein  27.49 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.23251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1155  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0910904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1164  hypothetical protein  27.49 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.122188  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2665  hypothetical protein  27.49 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.296084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>