123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1250 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  98.59 
 
 
213 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  79.81 
 
 
213 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  79.81 
 
 
213 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  80.28 
 
 
213 aa  341  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  78.4 
 
 
213 aa  339  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4323  hypothetical protein  79.81 
 
 
213 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000219277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  74.06 
 
 
214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  74.06 
 
 
214 aa  318  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  73.81 
 
 
212 aa  295  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  64.62 
 
 
214 aa  279  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  34.13 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  34.02 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  35.68 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  32.69 
 
 
211 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  34.95 
 
 
206 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1434  tetratricopeptide TPR_4  37.09 
 
 
206 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000778847  normal  0.941681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1546  tetratricopeptide TPR_4  35.89 
 
 
206 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  34.78 
 
 
206 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  33.96 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  36.7 
 
 
208 aa  99  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  29.63 
 
 
206 aa  99  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1500  hypothetical protein  30.77 
 
 
224 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  36.23 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  36.67 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1483  hypothetical protein  30.77 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  36.67 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  29.63 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  32.54 
 
 
209 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  36.32 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2735  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  31.55 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1307  tetratricopeptide TPR_4  34.1 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000516271  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  32.52 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  35.61 
 
 
227 aa  92  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  31.07 
 
 
211 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3007  hypothetical protein  29.67 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  33.9 
 
 
214 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  36.67 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1230  hypothetical protein  34.76 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833098  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1301  hypothetical protein  34.76 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.311769  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  36.67 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1129  hypothetical protein  36.28 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0290  hypothetical protein  34.76 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1231  hypothetical protein  34.76 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.50752  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  36.67 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  32.86 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1343  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2352  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0731  putative outer membrane protein  33.82 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1833  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0064  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2188  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2226  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1105  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  32.45 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2650  hypothetical protein  34.29 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1118  hypothetical protein  35.07 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.587767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1748  hypothetical protein  36.19 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  35.07 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  29.27 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  34.6 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3003  hypothetical protein  33.18 
 
 
206 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205779  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004347  hypothetical protein  32.86 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  35.89 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2236  hypothetical protein  33.98 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1721  hypothetical protein  35.71 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.434202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  34.12 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  33.01 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  36.84 
 
 
231 aa  85.1  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  31.1 
 
 
223 aa  84.7  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  32.07 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  33.01 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  31.55 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3607  hypothetical protein  29.61 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.55841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1170  hypothetical protein  29.19 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00566942  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  31.91 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  29.52 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  29.52 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  30.54 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1660  hypothetical protein  32.45 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1258  tetratricopeptide TPR_2  34.13 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1260  Protein of unknown function DUF2133  33.01 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3737  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02405  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.23251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1155  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0910904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2664  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00194573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2797  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00154022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1164  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.122188  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2665  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.296084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  36.17 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2888  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0840706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02367  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.350495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01056  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06110  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1188  hypothetical protein  29.67 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.358508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0416  hypothetical protein  29.67 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  30.16 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1295  hypothetical protein  29.67 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>