121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0885 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  97.65 
 
 		 213 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4323  hypothetical protein  95.31 
 
 		 213 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000219277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  79.81 
 
 		 213 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  78.87 
 
 		 213 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  77 
 
 		 213 aa  332  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  74.06 
 
 		 214 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  73.58 
 
 		 214 aa  317  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  72.38 
 
 		 212 aa  290  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  62.74 
 
 		 214 aa  275  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  33.65 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  35.65 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1546  tetratricopeptide TPR_4  36.62 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1434  tetratricopeptide TPR_4  36.97 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000778847  normal  0.941681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  33.86 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  31.73 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  34.43 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  37.37 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  32.55 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1118  hypothetical protein  34.76 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.587767  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  30.95 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3007  hypothetical protein  32.86 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1230  hypothetical protein  32.86 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1301  hypothetical protein  32.86 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.311769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1231  hypothetical protein  32.86 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.50752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  31.9 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1307  tetratricopeptide TPR_4  32.71 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000516271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  33.53 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2735  hypothetical protein  29.95 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  31.88 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  30.58 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1500  hypothetical protein  29.11 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  27.54 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1129  hypothetical protein  35.38 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2650  hypothetical protein  31.92 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1483  hypothetical protein  29.11 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  30.1 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  33.18 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  33.17 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  32.52 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  31.78 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  30 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1343  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2352  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1833  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0064  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2188  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2226  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1105  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02405  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.23251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1155  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0910904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02367  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.350495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2664  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00194573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2797  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00154022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1164  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.122188  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2665  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.296084 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2888  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0840706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  33.5 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3737  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  30.95 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  31.38 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0290  hypothetical protein  30.92 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3003  hypothetical protein  30.84 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  30.84 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1258  tetratricopeptide TPR_2  32.23 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  30.98 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  32.06 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  33.18 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  33.18 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2236  hypothetical protein  33.18 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  33.18 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  31.75 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1748  hypothetical protein  33.18 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  31.28 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  31.75 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1721  hypothetical protein  32.7 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.434202 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0736  Protein of unknown function DUF2133  32.8 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2889  hypothetical protein  28.99 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2715  hypothetical protein  28.99 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2778  hypothetical protein  28.99 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2759  hypothetical protein  28.99 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2672  hypothetical protein  28.99 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3607  hypothetical protein  28.02 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.55841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0731  putative outer membrane protein  30.43 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  28.64 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  28.64 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1660  hypothetical protein  32.6 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004347  hypothetical protein  29.52 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1170  hypothetical protein  27.88 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00566942  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  29.35 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  31.1 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1188  hypothetical protein  29.25 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.358508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0416  hypothetical protein  29.25 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1295  hypothetical protein  29.25 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  29.69 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>