48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0684 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0684  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0654  hypothetical protein  94.7 
 
 		 264 aa  504  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.755605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1900  hypothetical protein  51.24 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000294416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  27.01 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1129  hypothetical protein  33.63 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  27.11 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  29.22 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0406  hypothetical protein  28.02 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  28.51 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1301  hypothetical protein  28 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.311769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1230  hypothetical protein  28 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1231  hypothetical protein  28 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.50752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  27.13 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  27.59 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  28.8 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  28.7 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  28.12 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  28.12 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  24.64 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  28.84 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004347  hypothetical protein  26.6 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  24.76 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3124  TPR-like domain-containing protein  26.82 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  26.85 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  24.76 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  24.12 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  27.36 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  25.69 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  25.69 
 
 		 206 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2650  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2735  hypothetical protein  25.5 
 
 		 208 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01069  hypothetical protein  26.29 
 
 		 204 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  27.19 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  29.37 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3003  hypothetical protein  26.15 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  25.23 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  25.71 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1258  tetratricopeptide TPR_2  23.5 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524516  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1295  hypothetical protein  24.66 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  25.48 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  26.7 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  27.54 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3737  hypothetical protein  25.13 
 
 		 206 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  28.35 
 
 		 214 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  24.22 
 
 		 211 aa  42  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>