57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1900 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1900  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  559  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000294416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0684  hypothetical protein  51.24 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0654  hypothetical protein  51.24 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.755605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  28.33 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  28.76 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  31.47 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  30.45 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  30.81 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  30.67 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  30.21 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  28.64 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  28.64 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  33.5 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  31.98 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  32.83 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0406  hypothetical protein  27.84 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  30.5 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  30.92 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1231  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.50752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1230  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1301  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.311769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  29.15 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  29.55 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2650  hypothetical protein  29.82 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  29.74 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  29.55 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  29.55 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3003  hypothetical protein  29.17 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205779  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  28.64 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  27.19 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  24.5 
 
 		 223 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  28.12 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01069  hypothetical protein  32.5 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004347  hypothetical protein  29.02 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  26.82 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  29.59 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  30.41 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0290  hypothetical protein  30.82 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  31.03 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  31.79 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  31.79 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  25.89 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  31.03 
 
 		 213 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  26.2 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  26.2 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  28.11 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  29.28 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1170  hypothetical protein  24.12 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00566942  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1258  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1307  tetratricopeptide TPR_4  24.32 
 
 		 206 aa  42.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000516271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  29.3 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  29.08 
 
 		 209 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>