44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0654 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0654  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.755605  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0684  hypothetical protein  94.7 
 
 
264 aa  504  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020794  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1900  hypothetical protein  51.24 
 
 
278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000294416  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  28.44 
 
 
218 aa  89  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  28.81 
 
 
240 aa  72  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1129  hypothetical protein  32.74 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  27.31 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  27.98 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0406  hypothetical protein  28.02 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  26.85 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  26.85 
 
 
225 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  28.19 
 
 
213 aa  59.3  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  28.65 
 
 
206 aa  58.9  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  28.65 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  29.17 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1301  hypothetical protein  28.43 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.311769  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1230  hypothetical protein  28.43 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833098  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1231  hypothetical protein  28.43 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.50752  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  27.59 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  24.41 
 
 
206 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3124  TPR-like domain-containing protein  27.22 
 
 
207 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  24.62 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  26.56 
 
 
206 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  29.14 
 
 
214 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  27.65 
 
 
210 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3310  hypothetical protein  26.9 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  27.19 
 
 
227 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  24.76 
 
 
203 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  24.76 
 
 
203 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  26.67 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  26.42 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  26.11 
 
 
224 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  30.28 
 
 
219 aa  45.8  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  26.44 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2650  hypothetical protein  26.4 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2735  hypothetical protein  23.32 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2163  protein of unknown function DUF513 hemX  23.81 
 
 
410 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004347  hypothetical protein  25 
 
 
204 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  27.57 
 
 
214 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  30.85 
 
 
221 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1258  tetratricopeptide TPR_2  23.98 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  27.57 
 
 
214 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3146  hypothetical protein  25.38 
 
 
206 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.895231  normal  0.0225255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1375  hypothetical protein  25.38 
 
 
206 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.684089  normal  0.473029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>