133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2866 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  59.62 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  62.32 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  57.01 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  54.91 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  58.88 
 
 		 231 aa  234  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  54.67 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  54.76 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  50.45 
 
 		 225 aa  197  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0078  hypothetical protein  52.49 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  45.19 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  44.71 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  45.67 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  43.13 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  46.19 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  43.13 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  42.65 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  42.65 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  42.65 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2236  hypothetical protein  43.6 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1748  hypothetical protein  42.18 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1721  hypothetical protein  42.18 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.434202 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1343  hypothetical protein  43.13 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2352  hypothetical protein  43.13 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  41.23 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1833  hypothetical protein  43.13 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0064  hypothetical protein  43.13 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2188  hypothetical protein  43.13 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2226  hypothetical protein  43.13 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1105  hypothetical protein  43.13 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  41.71 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  40.76 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  39.52 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  37.56 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  40.38 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  41.4 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  36.41 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  37.67 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  36.15 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  33.15 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  36.7 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  36.17 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  34.04 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  30.85 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  31.38 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  29.47 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1500  hypothetical protein  27.17 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1483  hypothetical protein  27.17 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  28.78 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  30.11 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1660  hypothetical protein  32.09 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  30.32 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  30.32 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4323  hypothetical protein  30.32 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000219277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  29.79 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  32.61 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3007  hypothetical protein  31.75 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01056  hypothetical protein  30.41 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06110  hypothetical protein  30.41 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  29.51 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3737  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02405  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.23251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1155  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0910904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0623  hypothetical protein  29.33 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  28.36 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1253  hypothetical protein  31.6 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  28.36 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2664  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00194573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2797  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00154022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1164  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.122188  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2665  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.296084 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02367  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.350495  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2888  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0840706  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000294416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2759  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2778  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2715  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2889  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  27.57 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0731  putative outer membrane protein  28.43 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3607  hypothetical protein  29.67 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.55841 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0290  hypothetical protein  28.09 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0820  hypothetical protein  27.36 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.187346  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0654  hypothetical protein  28.24 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.755605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0736  Protein of unknown function DUF2133  27.32 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1188  hypothetical protein  28.27 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.358508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0416  hypothetical protein  28.27 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1295  hypothetical protein  28.27 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0374  hypothetical protein  29.89 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2988  hypothetical protein  32.21 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4513  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.105254 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>