127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1061 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1153  hypothetical protein  99.53 
 
 		 211 aa  413  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584457  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1061  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1217  hypothetical protein  90.05 
 
 		 211 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2104  hypothetical protein  63.98 
 
 		 210 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1465  hypothetical protein  66.67 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779591  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5111  hypothetical protein  66.67 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2084  hypothetical protein  65.4 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54263  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6269  hypothetical protein  68.1 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1810  hypothetical protein  68.1 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2539  hypothetical protein  66.19 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0300828  hitchhiker  0.00124926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1834  hypothetical protein  67.62 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1596  hypothetical protein  64.29 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0668016  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1748  hypothetical protein  66.19 
 
 		 209 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1721  hypothetical protein  66.19 
 
 		 209 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.434202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1418  hypothetical protein  66.67 
 
 		 208 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108097 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1343  hypothetical protein  69.52 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2352  hypothetical protein  69.52 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1833  hypothetical protein  69.52 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0064  hypothetical protein  69.52 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2188  hypothetical protein  69.52 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2226  hypothetical protein  69.52 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1105  hypothetical protein  69.52 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58844  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2236  hypothetical protein  68.57 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  49.51 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2189  hypothetical protein  46.12 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  44.66 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1994  hypothetical protein  45.54 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2983  putative transmembrane protein  46.41 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1616  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2866  hypothetical protein  44.71 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2606  hypothetical protein  45.15 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328129  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2375  hypothetical protein  40.48 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.526802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5017  hypothetical protein  43 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0329961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1092  hypothetical protein  42.51 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1172  hypothetical protein  42.03 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1426  hypothetical protein  43.96 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0596  hypothetical protein  38.94 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.383921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3388  hypothetical protein  41.9 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0666  hypothetical protein  38.25 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1289  hypothetical protein  37.04 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0078  hypothetical protein  43.27 
 
 		 226 aa  117  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2890  hypothetical protein  31.6 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  33.01 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  33.01 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40270  YfgM-like protein  33.98 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3498  hypothetical protein  36.41 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1500  hypothetical protein  28.27 
 
 		 224 aa  94.7  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4599  hypothetical protein  32.52 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1483  hypothetical protein  28.27 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1787  hypothetical protein  32.5 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1392  hypothetical protein  34.59 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1250  hypothetical protein  31.07 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1331  hypothetical protein  34.59 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1436  hypothetical protein  31.07 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1358  hypothetical protein  34.9 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000250297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1436  hypothetical protein  28.37 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.136443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4323  hypothetical protein  31.07 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000219277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  30.14 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0898  hypothetical protein  30.58 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.930556  hitchhiker  0.00000414617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0855  hypothetical protein  30.58 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0885  hypothetical protein  30.58 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17332  normal  0.505215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02979  putative membrane-associated protein with TPR-like domain  32.37 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1253  hypothetical protein  32.38 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4250  hypothetical protein  31.73 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0820  hypothetical protein  31.92 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.187346  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0290  hypothetical protein  32.69 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0623  hypothetical protein  26.44 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2856  hypothetical protein  30.77 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.750067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004347  hypothetical protein  34.6 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1292  tetratricopeptide TPR_4  28.71 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0753311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1120  hypothetical protein  29.94 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3607  hypothetical protein  27.49 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.55841 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0406  hypothetical protein  26.05 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2363  hypothetical protein  30.14 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00228748  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3007  hypothetical protein  26.44 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2735  hypothetical protein  26.34 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  29.44 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  29.44 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0731  putative outer membrane protein  29.33 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01056  hypothetical protein  32.08 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06110  hypothetical protein  32.08 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1295  hypothetical protein  25.96 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1188  hypothetical protein  25.96 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.358508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0416  hypothetical protein  25.96 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01069  hypothetical protein  32.95 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02405  hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.23251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1155  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0910904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2672  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2759  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3737  hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02367  hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.350495  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2778  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2889  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2664  hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00194573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2797  hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00154022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1164  hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.122188  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2665  hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.296084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2715  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2888  hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0840706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1546  tetratricopeptide TPR_4  27.75 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>