45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3303 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3303  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4513  hypothetical protein  60.81 
 
 		 222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.105254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3116  hypothetical protein  63.96 
 
 		 227 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2847  hypothetical protein  63.06 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0487  hypothetical protein  55.09 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0389  hypothetical protein  54.79 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0374  hypothetical protein  53.88 
 
 		 223 aa  228  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0691  hypothetical protein  47.66 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0373  hypothetical protein  39.91 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2277  hypothetical protein  33.95 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0282923  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2605  hypothetical protein  37.33 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.324907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3007  hypothetical protein  34.42 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11486  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4624  hypothetical protein  39.45 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2446  hypothetical protein  35.81 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.223439  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3507  hypothetical protein  34.63 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4042  hypothetical protein  38.94 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.163907  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4412  hypothetical protein  38.94 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1684  hypothetical protein  35.61 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0452445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4524  hypothetical protein  35.58 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3889  hypothetical protein  36.06 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0529534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2022  hypothetical protein  34.16 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1201  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0763  hypothetical protein  35.19 
 
 		 328 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0290872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3774  hypothetical protein  32.56 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126106  normal  0.979023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2318  hypothetical protein  33.8 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.273967  normal  0.21146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0943  hypothetical protein  33.18 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2543  hypothetical protein  37.07 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3124  hypothetical protein  28.29 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2496  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0989  hypothetical protein  28.85 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1164  hypothetical protein  31.34 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0432197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2425  hypothetical protein  28.79 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.77812  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3104  hypothetical protein  24.67 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2205  hypothetical protein  24.54 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.282453 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2162  hypothetical protein  28.83 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1354  hypothetical protein  26.64 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  0.0207762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2198  hypothetical protein  27.19 
 
 		 304 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.622668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0736  Protein of unknown function DUF2133  25.52 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2697  hypothetical protein  27.1 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0809503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1874  hypothetical protein  25.83 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2305  hypothetical protein  24.84 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3589  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2047  tetratricopeptide repeat family protein  29.41 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3086  hypothetical protein  28.23 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3494  hypothetical protein  24.84 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>