188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1274 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  45.22 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  43.48 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  45.06 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  45.06 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  45.06 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  48.72 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  45.06 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  46.35 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  45.49 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  47.32 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  44.49 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  44.65 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  44.65 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  44.65 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  44.65 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  48.87 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  44.19 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  44.19 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  44.19 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  44.19 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  45.33 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  46.35 
 
 		 251 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  40.95 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  41.96 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  46.33 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  46.33 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  42.38 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  44.81 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  40.71 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  41.9 
 
 		 287 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  44.08 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  41.7 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  45.03 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  34.89 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30.22 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  29.73 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  30.6 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  30.17 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  30.7 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  29.36 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  28.51 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  30.7 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  29.24 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  32.65 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  27.73 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  27.13 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  29.54 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  28.25 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  29.06 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  27.83 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  28.33 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  29.65 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  26.06 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  28.14 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.26 
 
 		 235 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.26 
 
 		 235 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  28.63 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  28.18 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  27.19 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  27.31 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  25.32 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  29.15 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  24.26 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  26.89 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  23.46 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  23.79 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  23.73 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  23.73 
 
 		 273 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  27.56 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  23.21 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  23.21 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  23.73 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  27.08 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  27.35 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  24.57 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  27.95 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  30.22 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  27.83 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  28.82 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  21.9 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  28.02 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  27.62 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  27.88 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  22.94 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  22.59 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  22.18 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  27.59 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  27.59 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  22.59 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  22.59 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  22.59 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  22.59 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  22.92 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  23.36 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  28.11 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  28.11 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  26.14 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  22.18 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  26.14 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>