254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3757 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  54.47 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  54.47 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  54.04 
 
 		 235 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  50.9 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  50.64 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  47.35 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  39.11 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  39.45 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  35.68 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  35.47 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  36.4 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  38.74 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  31.86 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  36.94 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  32.33 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  37.56 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  36.04 
 
 		 265 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  36.29 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  36.29 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  35.4 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  33.91 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  36.82 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  35.86 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  37.18 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  34.48 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  32.05 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  33.62 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  36.32 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  29.07 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  35.03 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  35 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  35.9 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  35.9 
 
 		 280 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  31.76 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  30.7 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  33.33 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  31.76 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  33.62 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  34.04 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  30.94 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  29.61 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  37.5 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  29.91 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  37.5 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  32.77 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  37.5 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  29.91 
 
 		 272 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  29.91 
 
 		 272 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  30.8 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  30.08 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  29.91 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  34.83 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  29.49 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  31.67 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  34.72 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  30.49 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  30.09 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  29.02 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  31.55 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  29.13 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  29.63 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  27.46 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  27.23 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  33.71 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  31.37 
 
 		 249 aa  89  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  27.43 
 
 		 273 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  30.59 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  27.43 
 
 		 285 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  27.43 
 
 		 273 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  31.22 
 
 		 242 aa  88.6  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  29.67 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  29.67 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  30.63 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  29.67 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  28.63 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  26 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  29.44 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  31.53 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  25.78 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  27.27 
 
 		 293 aa  86.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  28.71 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  31.08 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.9 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  31.08 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  33.17 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  30.99 
 
 		 238 aa  85.9  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  33.17 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  29.19 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  27.73 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  29.19 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  29.19 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  29.19 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  31.08 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.9 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.9 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.9 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.9 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.9 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.9 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>