237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2457 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  100 
 
 
235 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  90.64 
 
 
235 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  90.64 
 
 
235 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  57.46 
 
 
240 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  56.52 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  54.04 
 
 
242 aa  251  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  57.14 
 
 
258 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  39.81 
 
 
240 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  36.24 
 
 
234 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  36.8 
 
 
246 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  40.09 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  33.48 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  38.1 
 
 
258 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  39.74 
 
 
242 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  35.71 
 
 
244 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  38.33 
 
 
242 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  38.94 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  37.39 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.6 
 
 
228 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.84 
 
 
250 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  35.65 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  36.36 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  37.67 
 
 
243 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  36 
 
 
230 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  36 
 
 
230 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  34.25 
 
 
265 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  33.97 
 
 
253 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  30.7 
 
 
240 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  34.23 
 
 
252 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  33.78 
 
 
247 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  34.47 
 
 
230 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  31.49 
 
 
293 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  32.91 
 
 
255 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  29.44 
 
 
233 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  31.44 
 
 
233 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  32.54 
 
 
255 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  33.49 
 
 
253 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  33.84 
 
 
241 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  34.19 
 
 
233 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  29.96 
 
 
273 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  28.33 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  29.18 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  29.96 
 
 
273 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  29.96 
 
 
285 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  30.67 
 
 
255 aa  99  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  29.96 
 
 
273 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  30.22 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  32.61 
 
 
292 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  32.17 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  28.02 
 
 
247 aa  95.1  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  32.17 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  34.4 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  32.3 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  28.98 
 
 
286 aa  92.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  33.89 
 
 
257 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  28.76 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  33.89 
 
 
257 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  28.57 
 
 
230 aa  92  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  25.21 
 
 
229 aa  91.7  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  30.33 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  28.05 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  28.7 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  29.86 
 
 
266 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  33.33 
 
 
240 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  33.33 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  32.2 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  33.33 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  29.87 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  27.35 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  31.67 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  27.19 
 
 
241 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  32.29 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  27.78 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  27.9 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  25.46 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  29.79 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  28.63 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  28.63 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  28.63 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.33 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.63 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  30.17 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  30.51 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  28.21 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  28.21 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.78 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  28.21 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.78 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  29.28 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  27.72 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  32.78 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  31.74 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  28.99 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  25.75 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  27.72 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  28.21 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  26.69 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  26.69 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  26.69 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  31.88 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>