262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3299 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  100 
 
 
232 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  85.22 
 
 
252 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  83.91 
 
 
247 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  78.41 
 
 
230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  78.41 
 
 
230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  78.76 
 
 
230 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  76.62 
 
 
233 aa  317  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  57.66 
 
 
273 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  56.76 
 
 
285 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  56.76 
 
 
273 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  56.76 
 
 
273 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  55.86 
 
 
293 aa  255  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  54.35 
 
 
255 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  53.91 
 
 
255 aa  248  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  51.58 
 
 
236 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  53.36 
 
 
286 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  52.25 
 
 
237 aa  243  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  53.21 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  54.19 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  56.34 
 
 
230 aa  238  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  55.14 
 
 
231 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  50.65 
 
 
239 aa  234  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  47.53 
 
 
238 aa  230  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  46.43 
 
 
246 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  43.1 
 
 
244 aa  194  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  42.24 
 
 
244 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  46.4 
 
 
246 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  41.94 
 
 
242 aa  171  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  43.32 
 
 
258 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  37.39 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  34.89 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  34.25 
 
 
253 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  34.89 
 
 
280 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  34.89 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  40.91 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  36.68 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  40.91 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  33.63 
 
 
255 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  39.89 
 
 
292 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  36.93 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  34.55 
 
 
244 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  39.38 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  33.18 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  32.46 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30 
 
 
242 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  31.67 
 
 
228 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  29.13 
 
 
242 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  30.68 
 
 
265 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  33.33 
 
 
235 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  32.3 
 
 
235 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  33.33 
 
 
235 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  31.22 
 
 
257 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  28.44 
 
 
228 aa  98.6  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.63 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  31.43 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  36.26 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  30.28 
 
 
243 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  33.52 
 
 
233 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  29.73 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  33.9 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  31.66 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  31.96 
 
 
238 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  30.93 
 
 
238 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  32.98 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  29.46 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  29.86 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  26.84 
 
 
233 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  32.39 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  27.35 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  32.43 
 
 
246 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  29.2 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  32.02 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  27.83 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  31.11 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  31.66 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  32.12 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  31.22 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  29.73 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  33.02 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  27.66 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  32.26 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.83 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.83 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  32.09 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.83 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  28.9 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  31.46 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  28.65 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.39 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  28.95 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  29.61 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.39 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  32.58 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.83 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  31.41 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.39 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  28.32 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  28.28 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>