241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000053 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  100 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  49.57 
 
 
248 aa  221  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2036  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  64.81 
 
 
165 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712299  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  40.76 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  33.97 
 
 
256 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  35.76 
 
 
237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  32.24 
 
 
241 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  32.14 
 
 
238 aa  101  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  30.49 
 
 
239 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1763  AzlC family protein  36.13 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181843  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  29.33 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1117  AzlC family protein  36.04 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  26.75 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  28.57 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  29.87 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  26.64 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.33 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  34.35 
 
 
237 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.766728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.92 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  29.73 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  27.57 
 
 
236 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  30.63 
 
 
250 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.02 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.92 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.92 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.92 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  26.61 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.92 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  26.21 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  27.98 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  29.38 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  26.5 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  30.18 
 
 
228 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  28.17 
 
 
265 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  27.2 
 
 
245 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.02 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  32.97 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  32.17 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  28.12 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4739  AzlC-like  28.21 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  26.78 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  27.03 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  32.35 
 
 
238 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  32.27 
 
 
253 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  24.28 
 
 
249 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  30.77 
 
 
243 aa  88.6  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  26.22 
 
 
244 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  28.38 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  26.03 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  27.43 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  27.43 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  27.43 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  27.8 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  28.08 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  28.57 
 
 
233 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  28.08 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  28.08 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  30.94 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  25.57 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  29.21 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  27.59 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  28.43 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  30.56 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  29.44 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  33.71 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  28.95 
 
 
247 aa  82  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  28.81 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.1 
 
 
282 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  29.73 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  29.41 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  29.57 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  32.64 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  29.41 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  27.15 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  29.35 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  32.18 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  28.91 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  30 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  33.33 
 
 
257 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  27.88 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  33.33 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  32.08 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  30.08 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  25.53 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  33.33 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  30.3 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  32.04 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  33.33 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  30.18 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  32.04 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  30.3 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  33.33 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  33.14 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  32.4 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  33.71 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  27.64 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  33.53 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  24.46 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  26.01 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>