159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2155 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  100 
 
 
237 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.766728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1117  AzlC family protein  87.18 
 
 
235 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  40.61 
 
 
246 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  40.27 
 
 
249 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4739  AzlC-like  42.98 
 
 
246 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1763  AzlC family protein  43.72 
 
 
236 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181843  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  37.77 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  38.91 
 
 
313 aa  121  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  37.78 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  36.23 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  35.32 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  35.07 
 
 
239 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  34.4 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  34.4 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  34.4 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  36.04 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  35.32 
 
 
245 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  35.98 
 
 
244 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  33.33 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  34.25 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  34.4 
 
 
245 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  31.65 
 
 
236 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  31.88 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  34.25 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  31.88 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  33.77 
 
 
240 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  36.84 
 
 
248 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  31.22 
 
 
236 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  31.88 
 
 
242 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  34 
 
 
250 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  34.5 
 
 
243 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  31.94 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  31.94 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  31.94 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  32.92 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  35.23 
 
 
238 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  33.92 
 
 
243 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  34.36 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  30.94 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  32.46 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  28.99 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  28.16 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  31.14 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  31.14 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  30.14 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  30.73 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  33.93 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  30.8 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  29.71 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  34.67 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  25.78 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  28.26 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  20.81 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  29.21 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1523  AzlC-like  31.67 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.163351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  33.15 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  32.82 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  32.99 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  31.94 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  28.3 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  28.4 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  28.73 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  29.41 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  30.06 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  32.28 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2276  AzlC family protein  34.71 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  24.72 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  25.93 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  27.33 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  30.93 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.29 
 
 
282 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  31.4 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  29.61 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  26.87 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  28.57 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  26.94 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  24.16 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  27.62 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  27.42 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  29.07 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  27.27 
 
 
247 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  26.18 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  28.12 
 
 
307 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  29.35 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  31.71 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  23.76 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  25.27 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  25.27 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  25.27 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  25.27 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.66 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  24.74 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  25.27 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  30.04 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  25.27 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  24.74 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  36.79 
 
 
264 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  30.36 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  24.74 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  24.73 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>