226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1389 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  92.8 
 
 		 236 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  52.81 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  39.35 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  38.74 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  40.1 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  32.48 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  35.12 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  31.2 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1523  AzlC-like  39.23 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.163351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  31.03 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  29.44 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  28.7 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  31.72 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  30.84 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  30.84 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  30.84 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  31 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  35.07 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  39.39 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  31.33 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  30.9 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  30.43 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1117  AzlC family protein  31.72 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  28.51 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  29.05 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  29.05 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  29.05 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  31.22 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.766728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  28.02 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  28.51 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4739  AzlC-like  29.41 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  28.31 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  31.88 
 
 		 250 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  25.33 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  25 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  31.49 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  28.57 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  28.57 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  24.03 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  30.9 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  30.9 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  27.56 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.62 
 
 		 241 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.62 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.62 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.62 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.62 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.62 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  27.49 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  31.87 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.62 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  27.48 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.62 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  28.26 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  32.41 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  28.57 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1763  AzlC family protein  28.64 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181843  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  25.11 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  30.43 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  28.63 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  28.05 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  27.88 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  28.8 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  26.41 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  32.47 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  29.67 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  28.9 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  29.35 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  24.24 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  28.14 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  31.44 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  32.18 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  32.18 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  32.18 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  29.44 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  29.94 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  32.18 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  32.18 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  25.41 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  29.51 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  31.61 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  27.27 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.94 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  31.03 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  30.29 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  28.98 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  32.54 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  27.93 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  29.24 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  28.11 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  31.43 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  29.12 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  25.91 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  31.67 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  28.11 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  25.91 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  30.39 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  30.43 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  28.82 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>