269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0513 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  85.12 
 
 		 242 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  85.12 
 
 		 242 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  64.71 
 
 		 265 aa  277  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  67.84 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  51.95 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  49.77 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  56.44 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  49.16 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  41.59 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  47.62 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  42.39 
 
 		 253 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  43.51 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  42.29 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  42.08 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  42.08 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  42.01 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  41.25 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  42.15 
 
 		 255 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  41.03 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  42.15 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  38.01 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  40.26 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  44.02 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  41.78 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  34.38 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  38.12 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  42.23 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  38.33 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  42.23 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  38.33 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  38.94 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  35.32 
 
 		 250 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  36.05 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  37.18 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  37.83 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  32.3 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  31.74 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  40.59 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  30.84 
 
 		 286 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  28.75 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  29.13 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  30.34 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  29.74 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  29.74 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  29.31 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  31.08 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.36 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  29.49 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  30.7 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  28.38 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  31.56 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  29.06 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  30.22 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  29.13 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  30.22 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  37.06 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  30.22 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  31.11 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  37.5 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  32.09 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  35.83 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  34.76 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  32.17 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  32.17 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  32.17 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  32.17 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  32.17 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  32.59 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  32.17 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  30.67 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  35.71 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  31.74 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  30.25 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  29.36 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  31.3 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  31.25 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  34.98 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.87 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  28.57 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  28.89 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  32.51 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  31.58 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  34.52 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  31.38 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  36.24 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  29.91 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  28.57 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  28.02 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  28.63 
 
 		 276 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  31.75 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.07 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  27.31 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  28.83 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  30.77 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  28.83 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  30.65 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  28.83 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  30.65 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  28.09 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>