255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1459 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  100 
 
 
293 aa  584  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  86.69 
 
 
285 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  85.67 
 
 
273 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  85.32 
 
 
273 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  84.3 
 
 
273 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  85.48 
 
 
255 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  85.89 
 
 
255 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  91.82 
 
 
231 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  89.5 
 
 
230 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  72.56 
 
 
286 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  75.23 
 
 
238 aa  346  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  72.89 
 
 
245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  58.26 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  58.19 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  57.33 
 
 
236 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  59.91 
 
 
239 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  54.43 
 
 
252 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  54.39 
 
 
247 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  55.86 
 
 
232 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  53.33 
 
 
230 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  53.36 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  53.36 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  53.12 
 
 
233 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  49.12 
 
 
242 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  45.37 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  46.67 
 
 
244 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  45.78 
 
 
244 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  44.69 
 
 
246 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  37.44 
 
 
258 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  35.15 
 
 
244 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  35.84 
 
 
253 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  36.73 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  35.06 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  39.46 
 
 
249 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  33.93 
 
 
228 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  35.68 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  37.18 
 
 
280 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  37.18 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  41.57 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  41.57 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  36.13 
 
 
250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  37.55 
 
 
292 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.67 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  34.72 
 
 
246 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.99 
 
 
257 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.88 
 
 
265 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  32.14 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  32.3 
 
 
233 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  35.53 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  33.33 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  31.65 
 
 
235 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  31.65 
 
 
235 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  32.24 
 
 
229 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  31 
 
 
242 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  34.6 
 
 
241 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  31.12 
 
 
244 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  31.49 
 
 
235 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.67 
 
 
242 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  29.36 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  34.83 
 
 
233 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  32.34 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  29.6 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  28.76 
 
 
246 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  32.38 
 
 
240 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  28.15 
 
 
243 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  28.51 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  30.17 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  31.88 
 
 
234 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  28.63 
 
 
240 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  30.89 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  32.16 
 
 
242 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  32.14 
 
 
241 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  32.14 
 
 
241 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  32.14 
 
 
241 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  32.14 
 
 
241 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  30.99 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  30.99 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  31.7 
 
 
241 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  31.7 
 
 
241 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  31.7 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  29.23 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.67 
 
 
240 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  29.91 
 
 
240 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  31.25 
 
 
241 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  31.25 
 
 
241 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  29.69 
 
 
238 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  29.69 
 
 
238 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  29.8 
 
 
276 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  32.97 
 
 
242 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  27.27 
 
 
242 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  33.51 
 
 
238 aa  85.9  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  33.33 
 
 
239 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  33.33 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  25.88 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  30.47 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  30.47 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  30.74 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  30.47 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  30.47 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  30.47 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>