266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1381 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  100 
 
 
234 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  43.3 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  48.61 
 
 
240 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  49.09 
 
 
240 aa  185  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  42.6 
 
 
246 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  42.4 
 
 
234 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  42.92 
 
 
257 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  42.86 
 
 
228 aa  168  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  39.73 
 
 
240 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  42.92 
 
 
265 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  39.11 
 
 
242 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  41.7 
 
 
244 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  45.21 
 
 
242 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  44.75 
 
 
242 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  37.22 
 
 
234 aa  154  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  40.19 
 
 
258 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  35.59 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  36.24 
 
 
235 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  36.68 
 
 
235 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  36.68 
 
 
235 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  40.62 
 
 
258 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  42.01 
 
 
242 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  40.25 
 
 
247 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  44.64 
 
 
243 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  38.14 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  37.21 
 
 
253 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  37.33 
 
 
233 aa  131  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  35.75 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.65 
 
 
242 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  36.6 
 
 
249 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  36.6 
 
 
249 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  36.6 
 
 
249 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  36.6 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  36.08 
 
 
253 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  36.6 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  33.94 
 
 
251 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  36.6 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  36.6 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  33.64 
 
 
272 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  33.64 
 
 
251 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  33.64 
 
 
272 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  33.64 
 
 
255 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  32.7 
 
 
244 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  33.18 
 
 
251 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  35.24 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  32.57 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  34.53 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  32.11 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  31.19 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  29.73 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  33.49 
 
 
286 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  36.06 
 
 
287 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  36.5 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  32.57 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  36.36 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  39.09 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  36.5 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  30.73 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  35.18 
 
 
248 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  37.04 
 
 
249 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  33.64 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  33.94 
 
 
245 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  31.36 
 
 
276 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  30.8 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  30 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  33.18 
 
 
250 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  36.26 
 
 
252 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  34.4 
 
 
267 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  34.48 
 
 
265 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  36.26 
 
 
247 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  30.9 
 
 
244 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  31.46 
 
 
244 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  28.97 
 
 
266 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  32.71 
 
 
255 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  31.92 
 
 
273 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  31.84 
 
 
246 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  31.92 
 
 
285 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  31.92 
 
 
273 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  31.92 
 
 
273 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  34.88 
 
 
249 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  32.71 
 
 
280 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  33.53 
 
 
257 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  33.53 
 
 
257 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  35.5 
 
 
238 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  33.64 
 
 
264 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  31.55 
 
 
240 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  34.55 
 
 
241 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  32.11 
 
 
264 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  30.33 
 
 
247 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.11 
 
 
233 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  30.18 
 
 
240 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  31.88 
 
 
293 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  30.74 
 
 
255 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  30.81 
 
 
230 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  30.81 
 
 
230 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  30.36 
 
 
255 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  32.24 
 
 
231 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  32.23 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  30.81 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  35 
 
 
282 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>