167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0475 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  100 
 
 		 264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  96.97 
 
 		 264 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  82.89 
 
 		 265 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  64.03 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  61.96 
 
 		 266 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  56.28 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  56.5 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  57.44 
 
 		 272 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  57.44 
 
 		 272 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  58.87 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  58.72 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  58.37 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  55.47 
 
 		 251 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  58.37 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  55.47 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  58.37 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  57.96 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  57.96 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  57.96 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  57.96 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  59 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  55.47 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  58.16 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  41.2 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  48.42 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  48.42 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  47.16 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  43.88 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  46.19 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  49.73 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  37.16 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  42.93 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  42.03 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  44.09 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  32.75 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  31.94 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  31.95 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  32.27 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  32.29 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  31.22 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  30.77 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  28.1 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  28.33 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  26.53 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  26.19 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  29.65 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  26.02 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  29.65 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  28.44 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  26.12 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  26.12 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.68 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  25.81 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  26.36 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  26.56 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  27.5 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  27.39 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  25.91 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  30.3 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  26.24 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  31.21 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  31.61 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  28.24 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  26.29 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  28.82 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  28.51 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.15 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.15 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  28.07 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  28.65 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  27.76 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  23.91 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  31.03 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  27.8 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  25 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  27.03 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  25.96 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  26.81 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  25.81 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  28.32 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  29.49 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  30.43 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  28.85 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  25.21 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  30.43 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  28.07 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  28.85 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.38 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  25.33 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.41 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  30.84 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  26.53 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  28.85 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  28.57 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  28.57 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  28.85 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  28.57 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  28.21 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.57 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  27.16 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>