183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3876 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  100 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  69.4 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  59.17 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  55.65 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  52.05 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  52.05 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  53.51 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  51.24 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  52.15 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  52.02 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  41.59 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  45.87 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  41.44 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  43.38 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  41.86 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  41.53 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  42.86 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  42.45 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  44 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  41.51 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  41.51 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  41.51 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  43 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  43 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  43 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  42.5 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  42.5 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  42.5 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  42.5 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  42.92 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  41.98 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  43 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  39.91 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  39.71 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  32.89 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  36.07 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  33.03 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  31.82 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  34.6 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  32.22 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  34.31 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  31.34 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  35.71 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  32.79 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  31.58 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  34.5 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  29.46 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  29.28 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  32.51 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  34.38 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  31.47 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  27.8 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  31.12 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  31.12 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  31.09 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  29.17 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  30.85 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  31.9 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  31.86 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  31.58 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  30.89 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  27.43 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  27.14 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  29.02 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  28.51 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  28.51 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  28.51 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  28.51 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  28.51 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  29.74 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  30.87 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  28.51 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  31.33 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.69 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.69 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.1 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  26.89 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  26.25 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  26.25 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  27.81 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  30.09 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  30.3 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  29.96 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  27.5 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  26.29 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  25.78 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  30.18 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  28.51 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  31.65 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  33.99 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  29.94 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  31.74 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  31.74 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  29.11 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  30.92 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  28.99 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  29.78 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.14 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  28.48 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  29.14 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>