265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0495 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  100 
 
 
257 aa  506  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  81.61 
 
 
265 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  71.06 
 
 
242 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  71.49 
 
 
242 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  67.84 
 
 
242 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  53.12 
 
 
228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  52.29 
 
 
233 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  50 
 
 
247 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  53.85 
 
 
243 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  42.6 
 
 
228 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  45.8 
 
 
258 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  42.92 
 
 
234 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  40.85 
 
 
240 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  40.09 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  41.32 
 
 
255 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  35.71 
 
 
250 aa  148  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  40.86 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  35.74 
 
 
244 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  40.17 
 
 
253 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  40.41 
 
 
250 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  40.17 
 
 
253 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  36.05 
 
 
240 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  39.9 
 
 
244 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  40.24 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  40.24 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  33.2 
 
 
238 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  39.74 
 
 
255 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  38.74 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  39.34 
 
 
234 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  32.51 
 
 
255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  36 
 
 
245 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  43.09 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  32.4 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  32.74 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  32.74 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  32.37 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  43.09 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  32.29 
 
 
285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  32.29 
 
 
273 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  30.99 
 
 
293 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  34.22 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  41.35 
 
 
249 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  30.6 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  33.91 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  36.2 
 
 
235 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  36.2 
 
 
235 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  32.59 
 
 
230 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  36.36 
 
 
235 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  30.29 
 
 
239 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  29.69 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  37.39 
 
 
258 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  30.33 
 
 
246 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  33.65 
 
 
251 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  33.65 
 
 
272 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  33.65 
 
 
272 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  31.49 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  30.51 
 
 
276 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  31.75 
 
 
251 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  34.26 
 
 
230 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  33.61 
 
 
233 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  34.26 
 
 
230 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  38.42 
 
 
238 aa  105  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  30.19 
 
 
266 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  35.38 
 
 
240 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  33.03 
 
 
252 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  33.04 
 
 
230 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  33.18 
 
 
251 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  34.12 
 
 
251 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  36.14 
 
 
282 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  31.36 
 
 
229 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  27.4 
 
 
233 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  37.17 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  31.41 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  32.88 
 
 
288 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  29.2 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  29.81 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  34.86 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  26.4 
 
 
238 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  35.75 
 
 
240 aa  95.9  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  33.63 
 
 
243 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  27.23 
 
 
238 aa  95.5  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  35.02 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  26.9 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  34.63 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  28.94 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  33.03 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  34.54 
 
 
249 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  34.65 
 
 
248 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  28.95 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  31.8 
 
 
234 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  31.92 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  34.02 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  32.1 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  29.39 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  32.24 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  31.5 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  32.1 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  32 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  32.29 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>