260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1055 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  100 
 
 
250 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  98 
 
 
280 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  98 
 
 
255 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  93.6 
 
 
255 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  90.59 
 
 
292 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  91.6 
 
 
257 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  92.02 
 
 
257 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  71.71 
 
 
253 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  72.22 
 
 
253 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  69.26 
 
 
255 aa  328  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  76.42 
 
 
249 aa  298  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  51.12 
 
 
258 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  40.87 
 
 
244 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  39.21 
 
 
250 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  41.25 
 
 
242 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  41.6 
 
 
242 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  42.17 
 
 
242 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  40.41 
 
 
257 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  37.83 
 
 
252 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  40.47 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  37.83 
 
 
247 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  39.38 
 
 
228 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  36.13 
 
 
293 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  35.32 
 
 
273 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  35.48 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  35.34 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  38.64 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  35.45 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  36.8 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  39.48 
 
 
233 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  37.5 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  37.79 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  36.07 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  37.79 
 
 
255 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  37.95 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  39.78 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  41.35 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  38.76 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  36.4 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  34.44 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  37.16 
 
 
246 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  35.84 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  36.87 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  34.38 
 
 
230 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  34.89 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  35 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  34.05 
 
 
234 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  34.38 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  34.38 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  36.49 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  29.9 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  36.32 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  33.18 
 
 
234 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  29.41 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  34.18 
 
 
239 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  35.45 
 
 
242 aa  111  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  32.54 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  32.64 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  33.05 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  33.05 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  33.05 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  33.05 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  33.84 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  33.05 
 
 
241 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  32.64 
 
 
241 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  32.22 
 
 
241 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  32.64 
 
 
241 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  31.8 
 
 
242 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  33.33 
 
 
240 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  38.25 
 
 
238 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  37.69 
 
 
282 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  35.78 
 
 
246 aa  105  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  37.89 
 
 
245 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  32.35 
 
 
244 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  36.21 
 
 
233 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  31.03 
 
 
229 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  34.03 
 
 
244 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  32.43 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  34.68 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  36.36 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  31.19 
 
 
240 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  36.51 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  32.89 
 
 
230 aa  96.3  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  32.22 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  33.64 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  31.49 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  31.49 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  32.9 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  32.9 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  32.9 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  33.33 
 
 
238 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  32.95 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  33.2 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  34.06 
 
 
251 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  38.95 
 
 
307 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  32.39 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  31.72 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  30.73 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  33.19 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  35.39 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>