245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02082 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  74.06 
 
 		 245 aa  348  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  79.05 
 
 		 242 aa  337  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  72.57 
 
 		 245 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  78.47 
 
 		 242 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  78.47 
 
 		 242 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  78.47 
 
 		 242 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  72.57 
 
 		 245 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  72.57 
 
 		 244 aa  328  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  70.35 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  69.91 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  70.35 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  70.35 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  64.37 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  70.83 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  63.87 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  61.33 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  60.89 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  38.65 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  37.44 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  38.57 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  32.73 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  34.47 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1117  AzlC family protein  37.73 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  32.9 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  35.84 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.766728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  37.76 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.16 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  31.71 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  30.51 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  32.14 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4739  AzlC-like  31.78 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  31.75 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  30.8 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  31.69 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  33.18 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  28.82 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  30.53 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  32.57 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  25.95 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1763  AzlC family protein  32.85 
 
 		 236 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181843  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  32.8 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  29.51 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  27.62 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  29.59 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  30.46 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  30.21 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  30.21 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.95 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.95 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  38.73 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.95 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.95 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.95 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.95 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.95 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  34.48 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.87 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  30.73 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  32.45 
 
 		 307 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.51 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.95 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  28.99 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  29.56 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.03 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1523  AzlC-like  30.41 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.163351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  33.52 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  31.15 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  31.91 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  30.9 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  35.17 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  30 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  31 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  36.48 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  29.07 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  29.89 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  29.89 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  33.15 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  30.91 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  29.28 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  28.65 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  32.79 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  28.74 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  38.37 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.6 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  32.97 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  29.82 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  27.42 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  30.1 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  30.53 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  35.57 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  26.67 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  32.54 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.04 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  31.07 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  31.78 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  27.32 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  29.55 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>