223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5135 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  100 
 
 
245 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  98.78 
 
 
245 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  95.9 
 
 
244 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  94.67 
 
 
244 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  95.08 
 
 
244 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  95.08 
 
 
244 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  95.08 
 
 
244 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  77.03 
 
 
242 aa  348  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  76.58 
 
 
242 aa  342  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  76.58 
 
 
242 aa  342  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  76.58 
 
 
242 aa  342  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  67.76 
 
 
245 aa  332  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  66.67 
 
 
246 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  73.91 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  70.28 
 
 
243 aa  304  7e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  61.9 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  62.34 
 
 
239 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  61.47 
 
 
246 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  37.98 
 
 
239 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  36.51 
 
 
256 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  35.58 
 
 
313 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  34.23 
 
 
249 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  36.92 
 
 
217 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  32.57 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  37.36 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  34.68 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  33.78 
 
 
245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  32.14 
 
 
265 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1117  AzlC family protein  34.86 
 
 
235 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  30.9 
 
 
236 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  35.32 
 
 
237 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.766728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  29.06 
 
 
229 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  30.74 
 
 
236 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4739  AzlC-like  33.33 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  29.28 
 
 
240 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  30.59 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  30.41 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  33.33 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  31.31 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  30.73 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  32.19 
 
 
236 aa  92.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1763  AzlC family protein  29.38 
 
 
236 aa  92  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181843  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  36.57 
 
 
238 aa  92  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  29.74 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  29.57 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  26.64 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  25.23 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  27.37 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  28.33 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1523  AzlC-like  28.97 
 
 
226 aa  85.5  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.163351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  26.44 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  36.27 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  28.57 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  30.89 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  26.88 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.37 
 
 
240 aa  82  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  31.38 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  30.73 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  29.48 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  25.96 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  25.96 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  25.96 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  27.78 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  30.59 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  30.71 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  25.48 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  25.96 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  25.96 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  25.96 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  25.96 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  25.48 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  27.05 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  28.99 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  29.48 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  28.41 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  27.23 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  33.53 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  23.83 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  24.5 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  31.32 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  25.93 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  29.46 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  31.11 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.15 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  28.4 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  28.18 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  27.81 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  27.81 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  27.81 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  30.05 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  27.81 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  27.81 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  29.23 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  30.23 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  31.29 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  26.36 
 
 
240 aa  72  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  28.57 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  26.78 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  27.6 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  27.03 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>