161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4739 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4739  AzlC-like  100 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  82.57 
 
 		 246 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  80.74 
 
 		 249 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  81.67 
 
 		 245 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1763  AzlC family protein  48.65 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181843  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  42.98 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.766728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1117  AzlC family protein  43.86 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  37.04 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  35.81 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  33.96 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  31.39 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  33.19 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  33.77 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  33.77 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  33.77 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  33.77 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  33.19 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  34.1 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  33.77 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  33.82 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  31.56 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  31.6 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  33.33 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  33.33 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  29.41 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  31.75 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  36.59 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  32.7 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  31.75 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  31.75 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  31.75 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  30.49 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  31.02 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  31.28 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  35.86 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  29.79 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  30.33 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  28.21 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  26.8 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  27.98 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  25.82 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  28.57 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.3 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  27.16 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  28.88 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1523  AzlC-like  28.38 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.163351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  28.73 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.77 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  29.06 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.27 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.19 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.19 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.19 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  31.82 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  26.79 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.77 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  24.89 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.65 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.05 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  26.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.19 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.19 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  28.14 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  25.93 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  29.36 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  26.11 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  27.75 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  26.92 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  29.31 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  29.89 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  23.76 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  23.76 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  26.96 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  27.98 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  24.45 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.02 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  24.86 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2349  AzlC family protein  27.32 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  30.05 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  28.42 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  25.41 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  30.05 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.92 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  28.65 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  28.96 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  28.96 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  28.25 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  27.46 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  28.96 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  29.63 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  28 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  29.02 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  25.86 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  27.43 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  27.66 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  27.48 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  26.7 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  25.26 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  26.92 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  28.49 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>