236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2852 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  61.16 
 
 		 243 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  60.71 
 
 		 243 aa  274  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  62.67 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  55.25 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  52.68 
 
 		 240 aa  234  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  37.2 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  34.51 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  33.91 
 
 		 246 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  32.61 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  32.61 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  32.61 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  32.75 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  32.61 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  33.05 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  32.62 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  35.03 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  31.74 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  35.03 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  31.93 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  35.03 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  35.03 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  31.34 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  32.17 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  31.79 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  36.63 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  35.8 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  32.97 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  31.05 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  31.28 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  34.94 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  31.36 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  31.28 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  31.28 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.77 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.77 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  31.28 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  33.83 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.95 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  31.28 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  32.29 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  37.13 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  32.31 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  29.68 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  35.96 
 
 		 307 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  31.55 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.82 
 
 		 282 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  27.66 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.32 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  31.34 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  29.82 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30.14 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  32.34 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  32.31 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  31.03 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  31.55 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  28.81 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  32.31 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  31.52 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  29.82 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  30.73 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  27.38 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  32.43 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  30.18 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  32.08 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  26.41 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  32.08 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  29.86 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  32.08 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  30.46 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  34.03 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  35.12 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  32.6 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  32.07 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  32.44 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  32.44 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  32.44 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  30.68 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  32.44 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  32.44 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  30.33 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  32.61 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  32.44 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  32.47 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  32.44 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  28.87 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  28.96 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  28.87 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  28.87 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  30.69 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  32.58 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  26.98 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  29.94 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  32.58 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  31.25 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  30.2 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  29.06 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  28.41 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  28.57 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  31.76 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>