252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0429 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  57.14 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  55.75 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  55.75 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  51.22 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  52.65 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  47.35 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  41.39 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  40.19 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  36.21 
 
 		 240 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  35.11 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  42.42 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  36.6 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  40.89 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  40.97 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  31.44 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  40.27 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  36.11 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  34.84 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  37.39 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  37.83 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  36.24 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  32.48 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.17 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  38.29 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  31.49 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  38.36 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  31.51 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  32.93 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  29.85 
 
 		 241 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  30.66 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  31.48 
 
 		 234 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  31.12 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  35.71 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  31.6 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  27.71 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  31.72 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  31.47 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  30.28 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  29.65 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  31.72 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  29.65 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  29.65 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  29.65 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  29.65 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  32.18 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  29.65 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  29.2 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  29.2 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  29.65 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  27.35 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  30.17 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  33.17 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.2 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  30.47 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  29.31 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  33.14 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  32.79 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  33.14 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  31.33 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  30.34 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  31.33 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  27.72 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  31.11 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  30.04 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  31.25 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  33.69 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  28.57 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  29.15 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  29.38 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  30.34 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  26.78 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  29.44 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  25.97 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  31.28 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  31.52 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  28.14 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  31.36 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  31.05 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  31.79 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  30.21 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  27.98 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  31.2 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  29.2 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  25.82 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  26.58 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  30.95 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  32.8 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  31.21 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  25.85 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  31.44 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  34.16 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  27.96 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  27.48 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  27.35 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  27.16 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  27.51 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  27.48 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  28.95 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>