257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1188 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  76.39 
 
 		 236 aa  361  7.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  77.39 
 
 		 247 aa  350  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  74.11 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  59.21 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  58.77 
 
 		 285 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  58.77 
 
 		 273 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  60.36 
 
 		 273 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  58.19 
 
 		 293 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  58.48 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  58.48 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  55.91 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  58.11 
 
 		 286 aa  262  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  59.43 
 
 		 231 aa  258  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  59.02 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  54.55 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  49.36 
 
 		 252 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  52.07 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  52.25 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  51.75 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  49.78 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  49.78 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  49.78 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  49.1 
 
 		 242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  46.09 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  43.86 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  45.5 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  45.37 
 
 		 246 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  36.61 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  38.64 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  34.73 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  34.73 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  40.23 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  34.56 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  35.53 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  34.58 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  40.11 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  37.63 
 
 		 250 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  40.11 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  38.02 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  40.11 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  38.02 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  31.51 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.6 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.88 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  35.71 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  34.36 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30.8 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  31.16 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  30.73 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  28.44 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.67 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.22 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  30.34 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  31.07 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  31.22 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  32.16 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  29.9 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30.39 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30.39 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.39 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30.39 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  29.9 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  29.9 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  30.34 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  30.39 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  29.9 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  35.83 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.8 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  32.4 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  28.05 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  29.71 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  30.15 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  31.65 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  27.35 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  34.38 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  28.63 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  27.11 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  27.11 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  28.43 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  33.33 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  26.32 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  25.32 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  27.23 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  28.7 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  27.63 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  27.78 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  32.03 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  28.57 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  23.21 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  28.65 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  27.35 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  32.32 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  32.49 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  23.5 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  27.27 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  29.91 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  30.85 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  29.94 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  28.25 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>