184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1426 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  53.81 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0648  AzlC family protein  42.49 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000031666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  38.66 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  42.86 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  42.04 
 
 		 236 aa  161  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  41.41 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  41.13 
 
 		 238 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  40.09 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2543  AzlC family protein  35.74 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  32.22 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  31.03 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  31.38 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  31.42 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  31.42 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  31.42 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  31.42 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  31.42 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  31.42 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  31.42 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.96 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  31.39 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  31.39 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.1 
 
 		 282 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.54 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30.54 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30.54 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.96 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30.54 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  30.13 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  31.67 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  30.13 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  30.25 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  31.1 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  32.62 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  29.71 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.43 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  36.3 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  31.28 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  30.58 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  31.28 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  28.86 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  35.57 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  30.84 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  31.37 
 
 		 247 aa  85.1  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  30.04 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  33.16 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  31.69 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  28.88 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  30.32 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  29.95 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  29.29 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  31.75 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  34.86 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  33.33 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  28.45 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  30.81 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  31.5 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  28.76 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  36.11 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  27.95 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  28.8 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  30.22 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  27.95 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  27.8 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  30.21 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  28.51 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  28.17 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  29.38 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  28.17 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  29.73 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  29.84 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  29.61 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  30.22 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  28.44 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2349  AzlC family protein  28.49 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  27.75 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  31.87 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  29.06 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.74 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0849  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  28.15 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000903381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  31.03 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  29.78 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  29.78 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  31.61 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  30.24 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  28.49 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  29.8 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1853  AzlC family protein  29.05 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  28.02 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  29.89 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  29.17 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  27.93 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  26.19 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  28.49 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  24.66 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  28.42 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  28.42 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  27.98 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  27.17 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>