233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0298 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  40.69 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  35.11 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  37.27 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  35.53 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  33.48 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  34.67 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.91 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  30.14 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  31.49 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  30 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  32.31 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  34.06 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  31.8 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  33.62 
 
 		 307 aa  99  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  31.67 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  30.16 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  30.56 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  26.56 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  32.43 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  31.37 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  34.44 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  31.67 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  26.14 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  26.14 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  29.79 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  26.14 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  26.14 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  26.14 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  26.14 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  25.73 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  25.73 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  25.31 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  32.34 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  35.75 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  30.67 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  32.29 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  33.87 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  29.44 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  33.03 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  31.69 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  30 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  31.18 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  32.48 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  27.78 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  29.55 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  31.61 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  31.49 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  32.93 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  30.67 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  36.81 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  30.32 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09380  4-azaleucine resistance probable transporter AzlC  29.65 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  29.44 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  31.67 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.4 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  32.16 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  30.25 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  30.88 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  31.41 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  26.51 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.94 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  30.95 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  28.24 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  30.64 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  32.29 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  30.64 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  30.64 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  30.64 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  30.73 
 
 		 265 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  30.64 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  30.64 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  30.64 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  30.34 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  32.24 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  31.21 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  27.78 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  29.86 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  29.86 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  26.37 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  28.85 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0849  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.01 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000903381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2750  putative branched-chain amino acid transporter  29.27 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  28.44 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  31.22 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  31.4 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  31.22 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  31.22 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  31.61 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.86 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  26.6 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  32.26 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  28.23 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  26.83 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  25.34 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  29.38 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  30 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0648  AzlC family protein  29.44 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000031666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>