167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0563 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  100 
 
 
276 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  79.31 
 
 
266 aa  414  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  67.07 
 
 
265 aa  315  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  64.03 
 
 
264 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  64.03 
 
 
264 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  62.76 
 
 
251 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  57.96 
 
 
251 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  58.37 
 
 
251 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  56.42 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  56.42 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  59.59 
 
 
248 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  57.96 
 
 
251 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  57.55 
 
 
251 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  59.59 
 
 
249 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  59.59 
 
 
249 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  58.94 
 
 
253 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  58.63 
 
 
249 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  58.63 
 
 
249 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  58.63 
 
 
249 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  58.63 
 
 
249 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  59.18 
 
 
249 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  58.37 
 
 
251 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  59.35 
 
 
248 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  43.48 
 
 
241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  51.69 
 
 
249 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  51.21 
 
 
249 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  43.68 
 
 
267 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  49.03 
 
 
287 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  46.38 
 
 
288 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  40.37 
 
 
246 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  40.76 
 
 
255 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  46.67 
 
 
252 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  44.39 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  41.46 
 
 
249 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  37.33 
 
 
234 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  29.91 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  32.11 
 
 
240 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  33.76 
 
 
240 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  31.78 
 
 
244 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  31.8 
 
 
246 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.51 
 
 
257 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  29.07 
 
 
240 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  31.82 
 
 
234 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  30.13 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  31.56 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  30.32 
 
 
258 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  30.09 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  27.86 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.09 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  28.96 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  27 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.8 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  29.65 
 
 
242 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  27.2 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  30.52 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  26.82 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  30.28 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  28.88 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  29.52 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  28.33 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  26.46 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.66 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  27.52 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.23 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.23 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.23 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  29.91 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  26.92 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  30.77 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.66 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  25.85 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.77 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.77 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.23 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.63 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  29.32 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  26.48 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  28.95 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  26.48 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  26.52 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  28.32 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  32.13 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  30.62 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  30.36 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  30.8 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  31.1 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  29.02 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  29.55 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  26.94 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  29.46 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  29.46 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  31.3 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  28.02 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  27.23 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  29.58 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  28.99 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  25.51 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  26.27 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.49 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  30.77 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>