207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2276 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2276  AzlC family protein  100 
 
 
231 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  33.5 
 
 
238 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  35.15 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  38.18 
 
 
245 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.04 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  36.41 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  33.85 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  29.69 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  31.94 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  35.88 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  25.47 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  25.71 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4543  AzlC family protein  33.17 
 
 
227 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  24.76 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  25.71 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  25.71 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  25.71 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  25.24 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  26.13 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  35.09 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  25.24 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  24.76 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0648  AzlC family protein  25.3 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000031666  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1227  AzlC family protein  36.63 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581374  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0679  AzlC family protein  40.12 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  25.24 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  28.57 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  29.17 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  34.13 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2053  AzlC family protein  36.32 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.547201 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  26.87 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  33.01 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  32.08 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1138  hypothetical protein  35.5 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  30.64 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  35.03 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  24.61 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  22.3 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  26.39 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  22.97 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  25.45 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  25.45 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  35.29 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2254  AzlC family protein  36.54 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  27.19 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  27.19 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  27.19 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  32.16 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  27.57 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  27.19 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  27.57 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  31.46 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  27.19 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  27.19 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  27.19 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2467  AzlC family protein  39.81 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  33.54 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  29.03 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  21.26 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  30.94 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  22.97 
 
 
238 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  28.89 
 
 
238 aa  62  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  30.85 
 
 
258 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  34.86 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  28.06 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  25.69 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  27.04 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  26.98 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  30.33 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  29.5 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2886  AzlC family protein  32.67 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.922131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  34.48 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.766728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  26.52 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  30.94 
 
 
246 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  28.04 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  26.23 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1128  AzlC family protein  38.04 
 
 
275 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  23.81 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  26.11 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  25.87 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  27.83 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  30.48 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  31.95 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  26.14 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  32.54 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  25.66 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3162  AzlC family protein  31.76 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4080  AzlC family protein  33.88 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  28.57 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  28.48 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  28.48 
 
 
273 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  24.08 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  28.48 
 
 
273 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  30.48 
 
 
246 aa  55.8  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  32.56 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  29.94 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  28.48 
 
 
285 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1401  AzlC family protein  31.66 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.143592  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  28.41 
 
 
258 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  27.32 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>