More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0799 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0799  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.745929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  89.39 
 
 		 393 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  53.85 
 
 		 375 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  52.79 
 
 		 382 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  47.94 
 
 		 386 aa  184  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  44.56 
 
 		 380 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  43.59 
 
 		 362 aa  145  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  42.93 
 
 		 384 aa  141  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  37.32 
 
 		 369 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  40.41 
 
 		 377 aa  134  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  40.41 
 
 		 377 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  40.21 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  36.54 
 
 		 370 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  37.81 
 
 		 372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  36.79 
 
 		 376 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  35.08 
 
 		 374 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  35.08 
 
 		 374 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  32.39 
 
 		 367 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  39.38 
 
 		 376 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  34.33 
 
 		 370 aa  125  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  36.32 
 
 		 364 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  39.11 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  33.85 
 
 		 369 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  34.2 
 
 		 369 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  33.85 
 
 		 369 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  39.38 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  34.55 
 
 		 376 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  31.61 
 
 		 377 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  34.39 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  37.37 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  34.72 
 
 		 365 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  30.65 
 
 		 413 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  32.27 
 
 		 388 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  35.35 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  41.36 
 
 		 401 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  37.19 
 
 		 386 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  34.36 
 
 		 368 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  33.68 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  33.85 
 
 		 368 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  32.8 
 
 		 258 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  35.18 
 
 		 370 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  33.16 
 
 		 382 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  35.71 
 
 		 378 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  34.92 
 
 		 366 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  35.71 
 
 		 378 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  34.92 
 
 		 366 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  34.92 
 
 		 366 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  38.04 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.16 
 
 		 383 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  32.29 
 
 		 258 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  35.57 
 
 		 250 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  32.64 
 
 		 373 aa  111  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  32.29 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  35.26 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  34.04 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  35.23 
 
 		 368 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  37.82 
 
 		 376 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  32.83 
 
 		 384 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  37.17 
 
 		 384 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  34.67 
 
 		 382 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  32.8 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  35.03 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  34.72 
 
 		 384 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  35.26 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  36.08 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  32.16 
 
 		 379 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  36.13 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  31.66 
 
 		 374 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  32.65 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  32.31 
 
 		 375 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  32.14 
 
 		 368 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  31.16 
 
 		 374 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  33.51 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  31.16 
 
 		 447 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  105  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  31.38 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  35.75 
 
 		 394 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  31.47 
 
 		 371 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  35.23 
 
 		 406 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  34.03 
 
 		 377 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  36.41 
 
 		 260 aa  104  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  33.68 
 
 		 264 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  35.75 
 
 		 383 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  30.65 
 
 		 374 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  32.81 
 
 		 378 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  30.65 
 
 		 374 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  33.52 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  33.67 
 
 		 382 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  34.69 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  32.81 
 
 		 378 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  34.02 
 
 		 395 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  33.68 
 
 		 263 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  33.68 
 
 		 263 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  38.46 
 
 		 375 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  34.43 
 
 		 251 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  35.45 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>