More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1422 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1422  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 242 aa  481  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3258  triosephosphate isomerase  81.22 
 
 		 245 aa  341  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  72.5 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  72.08 
 
 		 250 aa  324  8.000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  76.03 
 
 		 261 aa  322  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  70.25 
 
 		 270 aa  322  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  71.25 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  71.49 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  70.42 
 
 		 248 aa  291  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  65.42 
 
 		 251 aa  288  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  65.42 
 
 		 248 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  62.34 
 
 		 248 aa  258  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  61.51 
 
 		 248 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  55.79 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  58.82 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  57.56 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  57.68 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  54.13 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  57.2 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  56.79 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  57.44 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  57.44 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  55.37 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  55.37 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  55.37 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  50.83 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  53.31 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  57.02 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  56.02 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  56.61 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  55.37 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  61.75 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  57.61 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  57.61 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  57.61 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  57.61 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  57.61 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  54.55 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  57.61 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  57.61 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  52.07 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  55.56 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 260 aa  229  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  55.79 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  55.79 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0819  triosephosphate isomerase  49.17 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  52.3 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  48.57 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  50.83 
 
 		 255 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  47.93 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 255 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 255 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 255 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 255 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  51.03 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  50.83 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  49.59 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  54.98 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 		 248 aa  221  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  50.42 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  47.92 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51.3 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  44.77 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  46.31 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  51.06 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01687  triosephosphate isomerase  48.97 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000150844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>