More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0507 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0507  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
296 aa  598  1e-170  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.110855 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1590  dihydroorotate dehydrogenase  78.16 
 
 
295 aa  457  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1692  dihydroorotate dehydrogenase  70.89 
 
 
297 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.029227  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1778  dihydroorotate dehydrogenase  66.9 
 
 
294 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000536627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  29.39 
 
 
356 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  28.98 
 
 
356 aa  92.4  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.48 
 
 
356 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  29.39 
 
 
340 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.47 
 
 
359 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.37 
 
 
358 aa  85.9  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  26.51 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0564  dihydroorotate oxidase  30.12 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0108543 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.16 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.35 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.67 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.69 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.5 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.68 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.85 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.07 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.85 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.32 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.81 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.86 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.79 
 
 
362 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  25.09 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.48 
 
 
350 aa  82  0.000000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.16 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.07 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  27.78 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.07 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.97 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.97 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.51 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.44 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.62 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.41 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.89 
 
 
350 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.8 
 
 
351 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.54 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.07 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.4 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.08 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0729  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.97 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000867503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.8 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.99 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.71 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.11 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.83 
 
 
358 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.09 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.95 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.91 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.47 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.75 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.77 
 
 
352 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.67 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.07 
 
 
354 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.77 
 
 
352 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.52 
 
 
351 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.64 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.75 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1055  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.57 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.09 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  27.87 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  27.44 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.65 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.93 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  26.83 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.47 
 
 
353 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  28 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.7 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.77 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.39 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.35 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.92 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.36 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.92 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.97 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  29.64 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.67 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  23.42 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.13 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.16 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.02 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.02 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.38 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.3 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  25 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.97 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.3 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>