More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1590 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1590  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
295 aa  587  1e-167  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0507  dihydroorotate dehydrogenase  78.16 
 
 
296 aa  458  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.110855 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1692  dihydroorotate dehydrogenase  75.09 
 
 
297 aa  434  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.029227  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1778  dihydroorotate dehydrogenase  72.26 
 
 
294 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000536627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.85 
 
 
349 aa  96.3  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  27.1 
 
 
356 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.69 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.81 
 
 
344 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.68 
 
 
363 aa  89.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.7 
 
 
356 aa  89.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  28.04 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.91 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.52 
 
 
352 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.99 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.4 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  29.49 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.4 
 
 
364 aa  86.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.4 
 
 
364 aa  86.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.17 
 
 
365 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.99 
 
 
354 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.59 
 
 
339 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.39 
 
 
315 aa  85.5  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.48 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.75 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.66 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.1 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.71 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.83 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.31 
 
 
350 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  27.43 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.14 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.17 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.97 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.41 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.79 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.3 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.28 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.76 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  26.82 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.33 
 
 
362 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.97 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.16 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.22 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  25.87 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  27.78 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.88 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  27.62 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.81 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.48 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.16 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.38 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.16 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1055  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.09 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.52 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.33 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.55 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.98 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.38 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.52 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.55 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.18 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.13 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.56 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.62 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.03 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  26.76 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.08 
 
 
350 aa  79  0.00000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.72 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.2 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.76 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.29 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.65 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.82 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.39 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.64 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.39 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  22.87 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.69 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.92 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  23.88 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  25.83 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.77 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.44 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  29.77 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.25 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  23.88 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.16 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.16 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1530  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.16 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.45 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>