More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1692 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1692  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
297 aa  590  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.029227  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1590  dihydroorotate dehydrogenase  75.09 
 
 
295 aa  435  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0507  dihydroorotate dehydrogenase  70.89 
 
 
296 aa  419  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.110855 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1778  dihydroorotate dehydrogenase  69.52 
 
 
294 aa  403  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000536627 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0564  dihydroorotate oxidase  35.48 
 
 
322 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0108543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.23 
 
 
344 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.12 
 
 
358 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.35 
 
 
344 aa  89.4  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.21 
 
 
336 aa  89  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.39 
 
 
340 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.17 
 
 
349 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.79 
 
 
365 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.58 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.29 
 
 
352 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.72 
 
 
356 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.64 
 
 
354 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.6 
 
 
352 aa  86.3  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.6 
 
 
352 aa  86.3  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.55 
 
 
355 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.11 
 
 
313 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  28.87 
 
 
340 aa  85.9  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.26 
 
 
352 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.42 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.6 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.6 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.64 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.77 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.73 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.01 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.8 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.01 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.96 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  26.24 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.14 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.21 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.65 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.75 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.56 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.11 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.33 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.33 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.33 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.33 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.33 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.33 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.33 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.94 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.19 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.72 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.85 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.72 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  26.57 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.85 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.27 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.89 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1530  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.85 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  27.13 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.86 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.86 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.35 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1164  dihydroorotate oxidase A  29.91 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.21 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.21 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.33 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  26.35 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.81 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.09 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.29 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.53 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.39 
 
 
350 aa  79  0.00000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.53 
 
 
352 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.22 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.79 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  26.6 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.83 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.95 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.86 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.63 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.76 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.95 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.26 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.95 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  26 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.37 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  26.96 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.17 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.95 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  27.41 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.79 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.47 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>