More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1853 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  71.59 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1445  30S ribosomal protein S15  65.91 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  63.33 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  63.33 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  58.89 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  48.91 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  49.44 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  54.32 
 
 		 87 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  54.32 
 
 		 87 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  53.49 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  55.84 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl284  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000259742  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2817  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  47.73 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  46.15 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2299  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  47.73 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  49.4 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0012  30S ribosomal protein S15  53.33 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  47.67 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  46.59 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  53.25 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  50.62 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0330  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  50.62 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  46.51 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  46.59 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  46.51 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>