More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0330 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0330  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 88 aa  176  8e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl284  30S ribosomal protein S15  79.55 
 
 		 88 aa  146  8e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000259742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  57.47 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  95.9  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  52.44 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  48.28 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 87 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  48.84 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  51.14 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  50 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  54.76 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>