More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1417 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  100 
 
 		 88 aa  174  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  70.93 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  75.9 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  123  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  68.24 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  120  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  71.08 
 
 		 89 aa  120  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 87 aa  120  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  65.88 
 
 		 91 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  72.62 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  66.27 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  63.86 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 88 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  67.47 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  67.06 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  67.06 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  64.29 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  67.06 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  67.44 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  64.71 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  64.71 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  64.71 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  64.71 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  67.07 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  65.12 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  65.88 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  60.24 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  61.18 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  61.73 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  61.45 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  61.9 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>