More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6518 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  51.11 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  100  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  96.7  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  50.57 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl284  30S ribosomal protein S15  56.63 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000259742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  95.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 92 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  46.51 
 
 		 92 aa  94.7  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  47.67 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  54.44 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1283  SSU ribosomal protein S15P  50.57 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  48.28 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  55.95 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  52.44 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2299  30S ribosomal protein S15  46.51 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0330  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  49.41 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3277  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  46.67 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  54.22 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  51.22 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  49.41 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  52.44 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1606  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3414  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.350426  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  49.43 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3236  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1131  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00579414  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  45.98 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  45.98 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0816  30S ribosomal protein S15  54.22 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3057  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>