More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3723 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  100 
 
 		 89 aa  179  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  133  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  67.42 
 
 		 89 aa  121  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  61.8 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 87 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 87 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  67.44 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0027  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0034  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  59.09 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0604  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0483  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397496  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0228  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00134414  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>